作為新興的空間基因組學領域的領先企業,Spatial Transcriptomics通過對基于組織樣品的cDNA文庫進行測序,將組織學和基因表達分析相結合,并開發了可視化基因表達和形態學數據的軟件。該公司的技術平臺結合顯微成像技術和RNA測序技術,能夠從一片完整的冰凍組織切片中,獲取切片上不同位置細胞中的完整的轉錄組數據。該平臺的工作流程將冰凍組織切片覆蓋在特定的玻璃矩陣芯片上。芯片上固定著能夠捕獲細胞中mRNA的探針。探針上攜帶的條形碼標志出它們在矩陣芯片上的位置。通過這種探針捕捉細胞中mRNA并進行測序的方法,研究人員可以觀察到哪些基因在組織的特定位置表達,并且可以定量檢測出它們的表達水平。
Spatial Transcriptomics公司聯合創始人Joakim Lundeberg表示:“從人類基因組測序到組織測序,再到單細胞測序,基因組學領域已經在很短的時間內取得了飛速進展。空間基因組測序將成為下一個發展前沿。”通過Spatial Transcriptomics公司的技術,研究人員不僅能夠獲得單細胞內的基因組數據,而且可以比較在組織不同部位的細胞中基因組信息的變化,了解細胞間的相互作用,為全面理解疾病的發生與發展提供寶貴的見解。此外,空間基因組學技術也為腫瘤學、神經科學和免疫學等疾病領域提供了豐富的可能性,還可用于更廣范圍的生物學研究,具有十分廣闊的應用前景。
“10x Genomics致力于尋求對生物學的全面理解,我們最近的增長和收購活動正呈指數地加速我們的進步,”10x Genomics首席執行官兼聯合創始人Serge Saxonov表示,“我們很高興Spatial Transcriptomics的團隊能與我們聯手。現在,研究人員不僅能夠了解細胞內部發生了什么,還能了解細胞活動相互之間的關系。這是謎題中另一個不可或缺的部分,讓我們更接近于看到生物學的全貌,從而推動新的研究發現。”
2018年,10x Genomics動作不斷。今年早些時間,10x Genomics在2018 AGBT大會上宣布推出Feature Barcoding技術。這項技術能夠對研究人員感興趣的特定生物組分以及同一細胞內無偏向的基因表達或免疫圖譜進行同時分析。近期,10x Genomics與BioLegend和Immudex合作開發了Feature Barcoding技術的相關應用,包括適用于細胞表面蛋白檢測的抗體panel以及適用于同時檢測抗原特異性T細胞應用的panel。
今年8月,10x Genomics宣布收購表觀遺傳學領域初創公司Epinomics。這一收購為10x Genomics帶來ATAC-seq技術和相關知識產權。10x Genomics隨后也將Epinomics專有的表觀遺傳技術整合到其Chromium Single Cell ATAC Solution中。在今年10月召開的2018 ASHG年會上,10x Genomics公司詳細闡述了新技術和解決方案,包括全新的Chromium Single Cell ATAC Solution。這一產品也成為第一款適用于快速且大規模并行分析單細胞表觀基因組特征的商業化解決方案。此外,該方案包括功能全面的軟件,可實現大規模單細胞ATAC-seq實驗的快速分析及可視化。
上個月,10x Genomics曾告訴《舊金山商業時報》,公司正計劃明年將其占地40,000平方英尺的運營空間遷移到150,000平方英尺的新址中,并預計在未來幾個月創造約200個新的工作崗位。今年4月份,10x Genomics還曾獲得了1.25億美元的資金,包括5000萬美元的D輪融資和7500萬美元的信貸融資。本次收購Spatial Transcriptomics是10x Genomics的最新擴張計劃。雙方本次聯手將如何整合基因組和組織學信息?10x Genomics又將如何撬動空間基因組學領域?還讓我們拭目以待。
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